RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622967.1

AC055717.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC055717.3, Length 595 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC055717.3-201ENST00000622967 MAGEB18Q96M61 343 aa14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TRIM2Q9C040 744 aa14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 GLRX2Q9NS18 164 aa14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 EXD2Q9NVH0 621 aa14.93□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 A0A087WZY1 265 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 H3BNH8 94 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ZNF195O14628 629 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ADH6P28332 368 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SFTPDP35247 375 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MAGEA8P43361 318 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CARD18P57730 90 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 STX1BP61266 288 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ETFDHQ16134 617 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 DCST2Q5T1A1 773 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 STK32CQ86UX6 486 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CDS1Q92903 461 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OR52E6Q96RD3 313 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PANX1Q96RD7 426 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 STOML1Q9UBI4 398 aa14.92□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 A0A1W2PP18 115 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 C7orf72A4D263 438 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OIP5O43482 229 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SSX4O60224 188 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SASH3O75995 380 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 IFNA2P01563 188 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 GUSBP08236 651 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 LINGO3P0C6S8 592 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MATN1P21941 496 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CD226Q15762 336 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MAVSQ7Z434 540 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ANKRD46Q86W74 232 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 LILRA2Q8N149 483 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 MIER2Q8N344 545 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 RNF128Q8TEB7 428 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 NEURL3Q96EH8 262 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TEX37Q96LM6 180 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OR7D2Q96RA2 312 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 RMND5AQ9H871 391 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PLCE1Q9P212 2302 aa14.91□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SHISA9B4DS77 424 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 C9JVG2 144 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 KHKP50053 298 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 NME5P56597 212 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PHC1P78364 1004 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CCNJQ5T5M9 372 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SAXO2Q658L1 398 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 HSD17B8Q92506 261 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 HTRA1Q92743 480 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 KLHL15Q96M94 604 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 OR52B2Q96RD2 323 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 FANCFQ9NPI8 374 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 POLE3Q9NRF9 147 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 PRSS50Q9UI38 385 aa14.9□□□□□ -0.02
AC055717.3-201ENST00000622967 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 STX11O75558 287 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 ENPP1P22413 925 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 IL32P24001 234 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 ATP12AP54707 1039 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.89□□□□□ -0.03
AC055717.3-201ENST00000622967 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms