RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	STON2	Q8WXE9	905 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ITCH	Q96J02	903 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GMEB1	Q9Y692	573 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NF1	P21359	2839 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PNR3	127 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KLF4	O43474	513 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ADAM11	O75078	769 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	THBD	P07204	575 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TFPT	P0C1Z6	253 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	BMP2	P12643	396 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CD53	P19397	219 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ENPP1	P22413	925 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MERTK	Q12866	999 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GNA13	Q14344	377 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	P2RY6	Q15077	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TTMP	Q5BVD1	217 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF208	O43345	1280 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CYP7B1	O75881	506 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PMS2P2	O95744	297 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NR2F1	P10589	423 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	IL7R	P16871	459 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC1A3	P43003	542 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OR3A2	P47893	321 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DIO1	P49895	249 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	IDH3A	P50213	366 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	H3F3A	P84243	136 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KEAP1	Q14145	624 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HDX	Q7Z353	690 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JPF8	293 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	CDHR4	A6H8M9	788 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	SULT2B1	O00204	365 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78

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