RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	SH3D21	A4FU49	640 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	BMP2	P12643	396 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SLC7A1	P30825	629 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PMM1	Q92871	262 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	DACH2	Q96NX9	599 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	OR5B2	Q96R09	309 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	LIME1	Q9H400	295 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	VAPA	Q9P0L0	249 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	F8	P00451	2351 aa		18.62	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CDHR4	A6H8M9	788 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	IL7R	P16871	459 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	UGT2B10	P36537	528 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CRISP3	P54108	245 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CTBP2	P56545	445 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	RAC3	P60763	192 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SYT14P1	Q58G82	188 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	FCRLA	Q7L513	359 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GRINA	Q7Z429	371 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ZNF563	Q8TA94	476 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GLRX2	Q9NS18	164 aa		18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996		A0A0G2JND7	137 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PPR1	153 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SIAH2	O43255	324 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GKN3P	P0CG01	181 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	POU2F1	P14859	743 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	EPS8	Q12929	822 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	FADD	Q13158	208 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CGB2	Q6NT52	195 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CDC20B	Q86Y33	519 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ARL5B	Q96KC2	179 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CALML5	Q9NZT1	146 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GMEB1	Q9Y692	573 aa		18.6	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PP18	115 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CFAP73	A6NFT4	308 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	FAAH	O00519	579 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PRG2	P13727	222 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	DIO1	P49895	249 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GNA13	Q14344	377 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	LIN52	Q52LA3	116 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ZNF550	Q7Z398	422 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	RETREG3	Q86VR2	466 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	C12orf49	Q9H741	205 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		18.59	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996		A0A0G2JPF8	293 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	ENO4	A6NNW6	628 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	C16orf97	H3BN30	126 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	HRG	P04196	525 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	FES	P07332	822 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	KCNJ5	P48544	419 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	POU4F3	Q15319	338 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	TESK1	Q15569	626 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	RNF220	Q5VTB9	566 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	PSD2	Q9BQI7	771 aa		18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
CS-222	ENST00000550996	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		18.58	■□□□□ 0.56

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