RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 PPP3CBP16298 524 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SHC1P29353 583 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CTBP2P56545 445 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RAC3P60763 192 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SIRPAP78324 504 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SELENBP1Q13228 472 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 NDUFAF6Q330K2 333 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 EPGNQ6UW88 154 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CMIPQ8IY22 773 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SLC43A2Q8N370 569 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZNF614Q8N883 585 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZFP90Q8TF47 636 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM234Q8WY98 164 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RAB8BQ92930 207 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZG16BQ96DA0 208 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZBTB18Q99592 522 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 FANCFQ9NPI8 374 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ACER3Q9NUN7 267 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 AGAP5A6NIR3 686 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KLF4O43474 513 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 OPN1LWP04000 364 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KITP10721 976 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PGCP20142 388 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 AGTR1P30556 359 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SFTPDP35247 375 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CDKN2CP42773 168 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 MVDP53602 400 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 NME5P56597 212 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SESN3P58005 492 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KCNJ10P78508 379 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TNK1Q13470 666 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 BEND4Q6ZU67 534 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZNF550Q7Z398 422 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RNF130Q86XS8 419 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PHC2Q8IXK0 858 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 OR52B2Q96RD2 323 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 INPP5KQ9BT40 448 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CR1P17927 2039 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RNF212BA8MTL3 300 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 FAAHO00519 579 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RFXANKO14593 260 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 UBDO15205 165 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PRKD3O94806 890 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 H6PDO95479 791 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KRT75O95678 551 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 C1QCP02747 245 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 THBDP07204 575 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 KCNJ5P48544 419 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 MAP2K6P52564 334 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CASP9P55211 416 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PLAURQ03405 335 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CHRNEQ04844 493 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 DMTNQ08495 405 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 BEX5Q5H9J7 111 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 NXNQ6DKJ4 435 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 STAC2Q6ZMT1 411 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 FCRLAQ7L513 359 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 STK32CQ86UX6 486 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ZNF611Q8N823 705 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-221ENST00000550734 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms