RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518483.5

EXO1-208, Transcript of exonuclease 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EXO1, Length 2,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXO1-208	ENST00000518483	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SH2D1B	O14796	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	NDUFS7	O75251	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	B3GAT3	O94766	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	HOXB2	P14652	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CR2	P20023	1033 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	GTF2H1	P32780	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ERF	P50548	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	NFYC	Q13952	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CSF3R	Q99062	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MYH7	P12883	1935 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483		F8VP50	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	LGALS2	P05162	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	IL9	P15248	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CD82	P27701	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ACVR1B	P36896	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CDKN2C	P42773	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SERPINB9	P50453	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MIS12	Q9H081	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SP140L	Q9H930	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	LCT	P09848	1927 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	NR3C1	P04150	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	XG	P55808	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TAS2R38	P59533	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ISL1	P61371	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SP4	Q02446	784 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TAF10	Q12962	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FADD	Q13158	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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