RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJC19Q96DA6 116 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RMDN1Q96DB5 314 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EPSTI1Q96J88 318 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCRL1Q96LA6 429 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF607Q96SK3 696 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA16Q9BXB7 569 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GANQ9H2C0 597 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF442Q9H7R0 627 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCYOX1Q9UHG3 505 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNK6Q9Y257 313 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VWA8A3KMH1 1905 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A6NIZ1 184 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 XKRYO14609 159 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LGI1O95970 557 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRPS2P11908 318 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNR1P21554 472 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FRKP42685 505 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASMTP46597 345 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRRX1P54821 245 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BIDP55957 195 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAP1BP61224 184 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SELENOTP62341 195 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP1Q07960 439 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC173Q0VFZ6 552 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NFE2L1Q14494 772 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC39A12Q504Y0 691 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STUMQ69YW2 141 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CASC4Q6P4E1 433 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC39A4Q6P5W5 647 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA19Q7Z5L4 167 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFNEQ86WN2 208 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPBP1Q86WP2 473 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CENPSQ8N2Z9 138 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR51S1Q8NGJ8 323 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR9G1Q8NH87 305 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MCOLN3Q8TDD5 553 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAB39BQ96DA2 213 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHAC1Q9BUX1 264 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VCPKMTQ9H867 229 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRD5A3Q9H8P0 318 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERVK-18Q9QC07 812 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MIOXQ9UGB7 285 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF639Q9UID6 485 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C2orf16Q68DN1 1984 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL7A1Q02388 2944 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HELTA6NFD8 242 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C4orf51C9J302 202 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBXN8O00124 270 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RHOBTB1O94844 696 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADCY5O95622 1261 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHDP01880 384 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRT14P02533 472 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADRB2P07550 413 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CPA3P15088 417 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF30P17039 623 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BDNFP23560 247 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NMT1P30419 496 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CALCRP30988 508 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STIP1P31948 543 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC26A3P40879 764 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OPRK1P41145 380 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CX3CR1P49238 355 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC10A7Q0GE19 358 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASPHQ12797 758 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA0087Q14695 138 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BOLA3Q53S33 107 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR139Q6DWJ6 353 aa-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms