RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487320.5

CLHC1-212, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLHC1, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-212ENST00000487320 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CISHQ9NSE2 258 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 FZR1Q9UM11 496 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SPTBN2O15020 2390 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.96□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 MYH11P35749 1972 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 A0A1B0GUV1 79 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GSAPA4D1B5 854 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OR5H15A6NDH6 313 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 IMPA2O14732 288 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 TM7SF2O76062 418 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GNA14O95837 355 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 IL1BP01584 269 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CAPN1P07384 714 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 PAEPP09466 180 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CPN1P15169 458 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 AMD1P17707 334 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GABRG2P18507 467 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 TSPAN8P19075 237 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 BCKDHBP21953 392 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OXTRP30559 389 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 KDSRQ06136 332 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF33AQ06730 810 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZP4Q12836 540 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 PNOCQ13519 176 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CUL2Q13617 745 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZMYND11Q15326 602 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DDI2Q5TDH0 399 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 PMF1Q6P1K2 205 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 TCEAL3Q969E4 200 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NT5C3BQ969T7 300 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GABRG3Q99928 467 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZPBPQ9BS86 351 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GPR83Q9NYM4 423 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 MBD2Q9UBB5 411 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 LRP12Q9Y561 859 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SPACA6W5XKT8 324 aa3.95□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 H3BMH7 237 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZSCAN12O43309 604 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 KLHL41O60662 606 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CEACAM4O75871 244 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NXPH2O95156 264 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 HNF1AP20823 631 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NT5EP21589 574 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GPR183P32249 361 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 HTR5AP47898 357 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 AIF1P55008 147 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ENPP2Q13822 863 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SLC17A1Q14916 467 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.94□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 SMIM29Q86T20 159 aa3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms