RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PARLQ9H300 379 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT15Q9NV35 164 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 USP16Q9Y5T5 823 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CPQQ9Y646 472 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 AUP1Q9Y679 476 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PP2D1A8MPX8 630 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TRDCB7Z8K6 153 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM72CH0Y354 149 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX46H3BTG2 121 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS8O00217 210 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CLOCKO15516 846 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10H3O60404 316 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP1P03956 469 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PVRP15151 417 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF24P17028 368 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MSR1P21757 451 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 DLX5P56178 289 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ILKQ13418 452 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 DPYSL3Q14195 570 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf28Q4W4Y0 310 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM72BQ86X60 149 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL16Q8N461 479 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SPERTQ8NA61 448 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 BEST4Q8NFU0 473 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TOMM40LQ969M1 308 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM80Q96HE8 168 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CUTCQ9NTM9 273 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA2Q9UM82 520 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR81Q562E7 1941 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM94Q12767 1356 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRR3A8MPY1 467 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MPTX1A8MV57 137 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MXQ7 604 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 WWP2O00308 870 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PDHXO00330 501 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PSTPIP1O43586 416 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKYO43930 277 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SRMP19623 302 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL3P20749 454 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTM3P21266 225 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CCKARP32238 428 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ACVR1BP36896 505 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 BCAP31P51572 246 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKXP51817 358 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LIM2P55344 173 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RIPK4P57078 832 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB11AP62491 216 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 VLDLRP98155 873 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIL2Q13356 520 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FHL1Q13642 323 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB11BQ15907 218 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL14Q16627 93 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ISXQ2M1V0 245 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PQLC3Q8N755 202 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF2Q99496 336 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF670Q9BS34 389 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms