RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416748.1

NUP35P2-201, Transcript of nucleoporin 35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NUP35P2, Length 943 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35P2-201ENST00000416748 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 GATSQ8NAP1 163 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KIFAP3Q92845 792 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 C8orf44Q96CB5 159 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ARL5BQ96KC2 179 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 IL17FQ96PD4 163 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CLCC1Q96S66 551 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RAB34Q9BZG1 259 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OR2AG1Q9H205 316 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PPA2Q9H2U2 334 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RHBGQ9H310 441 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NIPAL2Q9H841 368 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 IL26Q9NPH9 171 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NUP50Q9UKX7 468 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 METP08581 1390 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RNF212BA8MTL3 300 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 C11orf98E9PRG8 122 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 C16orf97H3BN30 126 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 FBP2O00757 339 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PSTPIP1O43586 416 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CHST1O43916 411 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CEACAM4O75871 244 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 MMP1P03956 469 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 SPAM1P38567 509 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ETV5P41161 510 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RFX3P48380 749 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CLDN18P56856 261 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ECSCRQ19T08 205 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ISXQ2M1V0 245 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 TIGITQ495A1 244 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 GTDC1Q4AE62 458 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 LRRC31Q6UY01 552 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OR2L13Q8N349 312 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OR6S1Q8NH40 331 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 MAPK15Q8TD08 544 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 GPR151Q8TDV0 419 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NEUROG1Q92886 237 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 ACBD6Q9BR61 282 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NT5DC2Q9H857 520 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PARVGQ9HBI0 331 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CLN8Q9UBY8 286 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CD300AQ9UGN4 299 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PDE10AQ9Y233 779 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 USP16Q9Y5T5 823 aa3.54□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 H3BMQ9 156 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 NR5A2O00482 541 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 PFKFB2O60825 505 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 HPP00738 406 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CCL2P13500 99 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 CD82P27701 267 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 DCKP27707 260 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 LCN1P31025 176 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 OPRD1P41143 372 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 IST1P53990 364 aa3.53□□□□□ -1.84
NUP35P2-201ENST00000416748 HSPA2P54652 639 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms