RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LAS2Q8IYD9 372 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GPR156Q8NFN8 814 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR8K3Q8NH51 312 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DCUN1D4Q92564 292 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BORCS8Q96FH0 119 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 USP3Q9Y6I4 520 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KMT2EQ8IZD2 1858 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 POM121CA8CG34 1229 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 REEP5Q00765 189 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNEQ04844 493 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FGFBP1Q14512 234 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TAF9Q16594 264 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD3Q96ES6 412 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 PDGFAP04085 211 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DCTP40126 519 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF74Q16587 644 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GTDC1Q4AE62 458 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AARDQ4LEZ3 155 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SULF2Q8IWU5 870 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR10G6Q8NH81 332 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LMO3Q8TAP4 145 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF546Q86UE3 836 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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