RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 APCDD1Q8J025 514 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D19Q8N5T2 526 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 C14orf79Q96F83 325 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 RSRP1Q9BUV0 290 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 DMRT3Q9NQL9 472 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP57Q9NU63 452 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 TINAGQ9UJW2 476 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 NPTNQ9Y639 398 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM218A2RU14 115 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 SURF4O15260 269 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 FGBP02675 491 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 UBBP0CG47 229 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 PDHA2P29803 388 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 UBA52P62987 128 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ST3GAL3Q11203 375 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 PEA15Q15121 130 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 PRRT3Q5FWE3 981 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 DPPA4Q7L190 304 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 MICU1Q9BPX6 476 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ENKD1Q9H0I2 346 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN10Q9HC96 672 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRR-201ENST00000283228 SYT5O00445 386 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 SCAMP1O15126 338 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 KCNAB3O43448 404 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A12O75746 678 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 IGSF6O95976 241 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 IMPA1P29218 277 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 DLSTP36957 453 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 AQP2P41181 271 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 OR7A5Q15622 319 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF626Q68DY1 528 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 CXCL17Q6UXB2 119 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ARL14Q8N4G2 192 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 MCHR1Q99705 422 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 SLITRK2Q9H156 845 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 HTTP42858 3142 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 M0QZQ0 153 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 RBBP9O75884 186 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 TYRP14679 529 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 MST1P26927 711 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 OMPP47874 163 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 DEFA6Q01524 100 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 KRT77Q7Z794 578 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 SPICQ8N5J4 248 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 STK35Q8TDR2 534 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRR-201ENST00000283228 OR5P2Q8WZ92 322 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms