RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 PRKCDQ05655 676 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MED21Q13503 144 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ELOA3Q8NG57 546 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ZNF570Q96NI8 536 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.62■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MPDZO75970 2070 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 G3V3Y1 287 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SLC16A6O15403 523 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 KLF4O43474 513 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 NEURL1O76050 574 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SNX4O95219 450 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 WISP1O95388 367 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 EPHA2P29317 976 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 COX10Q12887 443 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TSPAN31Q12999 210 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TTC23Q5W5X9 447 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SPINK14Q6IE38 97 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ARSKQ6UWY0 536 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 P3H2Q8IVL5 708 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TMEM234Q8WY98 164 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ST8SIA1Q92185 356 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 FAM122AQ96E09 287 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 OSGIN1Q9UJX0 560 aa20.61■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 E9PQ18 207 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CDK2AP1O14519 115 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SNPHO15079 494 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CLIC3O95833 236 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 IFI30P13284 250 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 PRKCAP17252 672 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 GPR4P46093 362 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CTBP2P56545 445 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 USP51Q70EK9 711 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 GRINAQ7Z429 371 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CNBD2Q96M20 576 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 OSMP13725 252 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 GSTM3P21266 225 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 FPR3P25089 353 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CCL11P51671 97 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 DLX5P56178 289 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MED17Q9NVC6 651 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 DKK4Q9UBT3 224 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 VDAC3Q9Y277 283 aa20.6■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MAKP20794 623 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 DNASE1L1P49184 302 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ESRRGP62508 458 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MFAP5Q13361 173 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 NPAS1Q99742 590 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SLC19A3Q9BZV2 496 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.59■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 A0A0G2JMM0 328 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PPB8 328 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PRS3 328 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CDC42EP2O14613 210 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MYF6P23409 242 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CXCR1P25024 350 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 MASP1P48740 699 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 OR1C1Q15619 314 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 CDK20Q8IZL9 346 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 DEPPQ9NTK1 212 aa20.58■□□□□ 0.89
UFD1-201ENST00000263202 SOX14O95416 240 aa20.57■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 CNR1P21554 472 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms