RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf170-201ENST00000623052 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.32□□□□□ -0.44
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C9orf170-201ENST00000623052 FOXS1O43638 330 aa12.32□□□□□ -0.44
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C9orf170-201ENST00000623052 RASGRP1O95267 797 aa12.32□□□□□ -0.44
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C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A1P53985 500 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ALG11Q2TAA5 492 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC36A2Q495M3 483 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD13Q7L211 337 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC22A18Q96BI1 424 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 WDR92Q96MX6 357 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 DTX4Q9Y2E6 619 aa12.32□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CENPBD1B2RD01 187 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HRKO00198 91 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RCBTB2O95199 551 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GPR75O95800 540 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 BMP8BP34820 402 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 PSG6Q00889 435 aa12.31□□□□□ -0.44
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