RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LIPAP38571 399 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EVX1P49640 407 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 BCL2L1Q07817 233 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NFATC2Q13469 925 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MPPE1Q53F39 396 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PYY3Q5JQD4 70 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR2T11Q8NH01 316 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DSN1Q9H410 356 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PP18 115 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NME4O00746 187 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NME2P1O60361 137 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MMP20O60882 483 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 WDR47O94967 919 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF1O95521 474 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GPIP06744 558 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DRD5P21918 477 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ACRV1P26436 265 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GABRR2P28476 465 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PTGER4P35408 488 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PRKXP51817 358 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DIO3P55073 304 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DEFA1P59665 94 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DEFA3P59666 94 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CSNK1G2P78368 415 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 E2F1Q01094 437 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GAB1Q13480 694 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CBFBQ13951 182 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LILRA6Q6PI73 481 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 Q6ZSR9 355 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MITD1Q8WV92 249 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ERGIC1Q969X5 290 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LRRC58Q96CX6 371 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNF32Q9H0A6 362 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZBP1Q9H171 429 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ASPDHA6ND91 283 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 LGALS8O00214 317 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR2J2O76002 312 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CLDN7O95471 211 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 GLUD1P00367 558 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 BPIP17213 487 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CCNOP22674 350 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLC6A2P23975 617 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CEACAM3P40198 252 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 PSMB10P40306 273 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RGS6P49758 472 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RAP1BP61224 184 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ARF6P62330 175 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 VLDLRP98155 873 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SORDQ00796 357 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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