RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 POLE4Q9NR33 117 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 STARD5Q9NSY2 213 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 C5orf42Q9H799 3197 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 EML5Q05BV3 1969 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MPDZO75970 2070 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 DAPL1A0PJW8 107 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SERINC4A6NH21 518 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 LMO7DNF2Z398 122 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TNFRSF10AO00220 468 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CASKO14936 926 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 RNF13O43567 381 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 IDH3BO43837 385 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SLC19A2O60779 497 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 IGKV1D-16P01601 117 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HLA-DQB1P01920 261 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MT-ND5P03915 603 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 WNT1P04628 370 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CD1AP06126 327 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SBK2P0C263 348 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 IL7P13232 177 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CELP19835 753 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 F8A1P23610 371 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 CD79BP40259 229 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FNTBP49356 437 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.229e-8■■■■□ 22
SMAD3-212ENST00000559937 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 LGALS3BPQ08380 585 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FZD5Q13467 585 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TDGQ13569 410 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 GRM7Q14831 915 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 DESI1Q6ICB0 168 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 OAFQ86UD1 273 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 AKAP14Q86UN6 197 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 C11orf74Q86VG3 221 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TPRA1Q86W33 373 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 KLBQ86Z14 1044 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SYS1Q8N2H4 156 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM99Q8N816 258 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TEX19Q8NA77 164 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 RNF217Q8TC41 542 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HTRA1Q92743 480 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HLA-CQ95604 372 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM203Q969S6 136 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SGTBQ96EQ0 304 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MVB12AQ96EY5 273 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 PEX11GQ96HA9 241 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TEAD3Q99594 435 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SLC38A3Q99624 504 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 SOSTQ9BQB4 213 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 NDC1Q9BTX1 674 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ALG8Q9BVK2 526 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 OR10A5Q9H207 317 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 PDE7BQ9NP56 450 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ABCB9Q9NP78 766 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 A0A087WUJ7 227 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FABP12A6NFH5 140 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-212ENST00000559937 FAM183AA6NL82 134 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms