RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	CAMK4	Q16566	473 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PCK2	Q16822	640 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	COPS6	Q7L5N1	327 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BIVM	Q86UB2	503 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PARG	Q86W56	976 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM17	Q86X19	198 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR2L2	Q8NH16	312 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NANP	Q8TBE9	248 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	LIPH	Q8WWY8	451 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FAM3C	Q92520	227 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	UPRT	Q96BW1	309 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TGM7	Q96PF1	710 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RIT2	Q99578	217 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ATF6B	Q99941	703 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SOST	Q9BQB4	213 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GNB4	Q9HAV0	340 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NMUR1	Q9HB89	426 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MBD2	Q9UBB5	411 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SUN2	Q9UH99	717 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DHRS7	Q9Y394	339 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		A0A0A6YYD4	124 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	LRIT2	A6NDA9	550 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR5H15	A6NDH6	313 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SNTN	A6NMZ2	147 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	WRB	O00258	174 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CYB561D2	O14569	222 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DUX1	O43812	170 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CTAG2	O75638	210 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLITRK3	O94933	977 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TSPAN12	O95859	305 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FH	P07954	510 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NPIPA8	P0DM63	369 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	HOXD10	P28358	340 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	LAP3	P28838	519 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RFC2	P35250	354 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FNTA	P49354	379 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NDST2	P52849	883 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BNIP1	Q12981	228 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GCKR	Q14397	625 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DPYSL2	Q16555	572 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	UPP1	Q16831	310 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CARD17	Q5XLA6	110 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		Q6ZR54	194 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		Q7L0L9	218 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PSMB7	Q99436	277 aa		2.56	□□□□□ -2

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