RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 UBXN11Q5T124 520 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD11Q693B1 232 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10K2Q6IF99 312 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8U1Q8NH10 309 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 M1APQ8TC57 530 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 APH1BQ8WW43 257 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2A7Q96R45 310 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CLCC1Q96S66 551 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF576Q9H609 170 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 AGRPO00253 132 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BHLHE40O14503 412 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FLRT2O43155 660 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EMC8O43402 210 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJB6O75190 326 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL18O95568 372 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NR2F6P10588 404 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ERCC2P18074 760 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FPR1P21462 350 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MPZP25189 248 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDX5P30044 214 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ADORA1P30542 326 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BDKRB1P46663 353 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CDK8P49336 464 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4D2P58180 307 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ERVFC1-1P60608 527 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZP1P60852 638 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OSTNP61366 133 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MXD1Q05195 221 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TCP10Q12799 353 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MLC1Q15049 377 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TCEA2Q15560 299 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SSX1Q16384 188 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TAZQ16635 292 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL7BQ6UX53 244 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP21Q8N119 569 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD6Q8NC69 237 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2L2Q8NH16 312 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 IL31RAQ8NI17 732 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NUBPLQ8TB37 319 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GRHL3Q8TE85 626 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CDS1Q92903 461 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CERS2Q96G23 380 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4K3Q96R72 315 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 F2RL3Q96RI0 385 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EXO5Q9H790 373 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms