RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51B5Q9H339 312 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED13Q9UHV7 2174 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR91A4D1P6 747 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRIT2A6NDA9 550 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHST10O43529 356 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERLIN1O75477 346 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4F21O95013 312 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETHE1O95571 254 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTA1P08263 222 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCR2P25025 360 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CERS1P27544 350 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHRP35869 848 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAGLUP54802 743 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERVK_113P63132 956 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RELAQ04206 551 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLC1Q07866 573 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPB3Q12988 150 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAPSNQ13702 412 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY6DQ14210 128 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA9Q16795 377 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED27Q6P2C8 311 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCSK4Q6UW60 755 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIGD4Q8IY51 512 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR34Q96EX3 536 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHD1Q9H4M9 534 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EQTNQ9NQ60 294 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF225Q9UK10 706 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLLPQ9Y342 182 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXNDC9O14530 226 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B4GALT2O60909 372 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMP10O95393 424 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN9O95484 217 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRB1P04280 392 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINA6P08185 405 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELA2AP08217 269 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPA3P15088 417 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADRA2CP18825 462 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NR1D1P20393 614 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IMPDH1P20839 514 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH3A1P30838 453 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XCR1P46094 333 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTR6P50406 440 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXA1P55317 472 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM53BQ14153 422 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASP8Q14790 479 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00303Q3SY05 128 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABHD13Q7L211 337 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA21Q7Z572 469 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPV3Q8NET8 790 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSLPQ969D9 159 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM10Q96HG1 83 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSF3RQ99062 836 aa7.69□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A8Q9BY19 250 aa7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms