RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 HERVK_113P63132 956 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DLG1Q12959 904 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RAB32Q13637 225 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA9Q16795 377 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 DSCAMO60469 2012 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 A8MVJ9 347 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 H7C0S8 307 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 CEACAM7Q14002 265 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IL23RQ5VWK5 629 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ANKFN1Q8N957 763 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ELP5Q8TE02 316 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 KCTD4Q8WVF5 259 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 UCN3Q969E3 161 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NTNG2Q96CW9 530 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF597Q96LX8 424 aa5.55□□□□□ -1.52
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