RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 VPS26AO75436 327 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TOM1L1O75674 476 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 BBOX1O75936 387 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEBLO76041 1014 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLITRK3O94933 977 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRATO95237 230 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRIM16O95361 564 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 DIRAS3O95661 229 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MOSP00540 346 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LALBAP00709 142 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 INSP01308 110 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IFNB1P01574 187 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CXCL10P02778 98 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MMP1P03956 469 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CSF2P04141 144 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 EPB41P11171 864 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGLL1P15814 213 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 STMN1P16949 149 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 FUT1P19526 365 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP6V1C1P21283 382 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CNR1P21554 472 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PAX7P23759 505 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANXA13P27216 316 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 HTR1EP28566 365 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PTPN6P29350 595 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NMT1P30419 496 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SHMT2P34897 504 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPS9P46781 194 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 KLK7P49862 253 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 EMDP50402 254 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RAP1BP61224 184 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RND3P61587 244 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SELENOTP62341 195 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IL9RQ01113 521 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TGFBR3Q03167 851 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 HSF2Q03933 536 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC10A7Q0GE19 358 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PJVKQ0ZLH3 352 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GGTLC2Q14390 218 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LAGE3Q14657 143 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSG5Q15238 335 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NSDHLQ15738 373 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 AANATQ16613 207 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR2B11Q5JQS5 317 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 C10orf120Q5SQS8 335 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM120AOSQ5T036 256 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TPGS2Q68CL5 300 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PVRIGQ6DKI7 326 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM159AQ6UWV7 190 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 Q6ZN92 141 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PAQR9Q6ZVX9 377 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC26A11Q86WA9 606 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM17Q86X19 198 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 VRK2Q86Y07 508 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF695Q8IW36 515 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MFSD6LQ8IWD5 586 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SKA3Q8IX90 412 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELMOD2Q8IZ81 293 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GCNT2Q8N0V5 402 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF619Q8N2I2 560 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 BCORP1Q8N888 145 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF615Q8N8J6 731 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACOT4Q8N9L9 421 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 C20orf203Q8NBC4 194 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 DENND6BQ8NEG7 585 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC54Q8NEL0 328 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 STXBP6Q8NFX7 210 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR2AP1Q8NGE2 309 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR8H1Q8NGG4 311 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR2A12Q8NGT7 310 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR56B4Q8NH76 319 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR9G1Q8NH87 305 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms