RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.41■■□□□ 1.18
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ECHDC3-201ENST00000379215 WDR70Q9NW82 654 aa22.41■■□□□ 1.18
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ECHDC3-201ENST00000379215 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.39■■□□□ 1.17
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ECHDC3-201ENST00000379215 E9PQ18 207 aa22.37■■□□□ 1.17
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ECHDC3-201ENST00000379215 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 H3BN98 237 aa22.36■■□□□ 1.17
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ECHDC3-201ENST00000379215 ING2Q9H160 280 aa22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.36■■□□□ 1.17
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ECHDC3-201ENST00000379215 CHMP24386 653 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 TACR3P29371 465 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 BICRALQ6AI39 1079 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 GALNT16Q8N428 558 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3-201ENST00000379215 CLIC3O95833 236 aa22.35■■□□□ 1.17
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