RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADOQ96SZ5 270 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AP1G1O43747 822 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAHP00439 452 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PFN3P60673 137 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BEND4Q6ZU67 534 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C4orf36Q96KX1 117 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLX4Q8IY92 1834 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 METTL15A6NJ78 407 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAPBPO15533 448 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADAM23O75077 832 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR7A5Q15622 319 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF77Q15935 545 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC22A12Q96S37 553 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LYRM4Q9HD34 91 aa15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LCATP04180 440 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TGFBR3Q03167 851 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 P2RX6O15547 441 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR2T7P0C7T2 308 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHRNEQ04844 493 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PPA1Q15181 289 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR2T27Q8NH04 317 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAC2P15153 192 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APLNRP35414 380 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LTB4RQ15722 352 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR78Q96P69 363 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDFQ9HBH1 243 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BPNT1O95861 308 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CR2P20023 1033 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CENPOQ9BU64 300 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCL26Q9Y258 94 aa15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DAPP51397 102 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR18Q14330 331 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SERINC4A6NH21 518 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARSBP15848 533 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARNTP27540 789 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LSSP48449 732 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C7orf72A4D263 438 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LINC01553A4QN01 128 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AKR1C4P17516 323 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC2A5P22732 501 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FPR3P25089 353 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLK5Q496M5 336 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STACQ99469 402 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms