RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251102.12

CNGB1-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel beta 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGB1, Length 5,641 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1-201ENST00000251102 ASAH1Q13510 395 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 OR7D2Q96RA2 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SERINC2Q96SA4 455 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 NME7Q9Y5B8 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 A0A1W2PP55 124 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 HTR3BO95264 441 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 WDPCPO95876 746 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 KIAA1024LP59773 190 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DCST2Q5T1A1 773 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ASB11Q8WXH4 323 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 HAS2Q92819 552 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SPIN2AQ99865 258 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 MED20Q9H944 212 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 MED17Q9NVC6 651 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FBXO24O75426 580 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GBX1Q14549 363 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TM9SF4Q92544 642 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 MYADMQ96S97 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 LUZP4Q9P127 313 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 OR6C6A6NF89 314 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FAM227AF5H4B4 570 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DVL2O14641 736 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SERPINA5P05154 406 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 BTG1P62324 171 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GIMAP5Q96F15 307 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 LRRC46Q96FV0 321 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 WDR92Q96MX6 357 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CPED1A4D0V7 1026 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CASRP41180 1078 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 PPT1P50897 306 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GMLQ99445 158 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 NFKBIEO00221 500 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TNFSF12O43508 249 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FGF18O76093 207 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 PNMTP11086 282 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 EPHA1P21709 976 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CLDN12P56749 244 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GAB1Q13480 694 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 NFATC4Q14934 902 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 BMFQ96LC9 184 aa14.5□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 PRKAR1BP31321 381 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 RGRP47804 291 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DUSP7Q16829 419 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SLC51BQ86UW2 128 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 PEX11GQ96HA9 241 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 A8MVJ9 347 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SIX6O95475 246 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CRABP1P29762 137 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 CD79BP40259 229 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 OR1Q1Q15612 314 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 BCL2A1Q16548 175 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 GAREM2Q75VX8 874 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ABHD4Q8TB40 342 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TGM7Q96PF1 710 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FZD9O00144 591 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ERVFC1P60507 584 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 PLGLB1Q02325 96 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGB1-201ENST00000251102 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms