RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WV62	115 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G10	O15496	165 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LYPD3	O95274	346 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CBX7	O95931	251 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EMD	P50402	254 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IDNK	Q5T6J7	187 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CADM2	Q8N3J6	435 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	AVL9	Q8NBF6	648 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SATB2	Q9UPW6	733 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GVC2	190 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A6NIN4	97 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RNF13	O43567	381 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RCBTB2	O95199	551 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CTBP2	P56545	445 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PPP3R1	P63098	170 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PSG6	Q00889	435 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HHEX	Q03014	270 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC3A1	Q07837	685 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM15	Q13444	863 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ASAH1	Q13510	395 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CRMP1	Q14194	572 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TRIQK	Q629K1	86 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OAF	Q86UD1	273 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LNX2	Q8N448	690 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C6	Q8NH72	309 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	STAC	Q99469	402 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TEAD3	Q99594	435 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TIMP4	Q99727	224 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RNF32	Q9H0A6	362 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	POT1	Q9NUX5	634 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GWA3	101 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM25A	B3EWG3	89 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM25C	B3EWG5	89 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM25G	B3EWG6	89 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		B4DGG1	531 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		J3QRE1	110 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NGFR	P08138	427 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNB1	P11230	501 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CTSE	P14091	401 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IL9	P15248	144 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DRD1	P21728	446 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DL3	P43628	341 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HCCS	P53701	268 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	YPEL5	P62699	121 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OOSP2	Q86WS3	158 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CTRC	Q99895	268 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		12.1	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		J3QLW9	94 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-16	P01601	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF19	P17023	458 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SHC1	P29353	583 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ACVR1B	P36896	505 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	E2F1	Q01094	437 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47

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