RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 EML5Q05BV3 1969 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR6C70A6NIJ9 312 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SLC19A2O60779 497 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 STX11O75558 287 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GYPBP06028 91 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PRKAR1AP10644 381 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GPR18Q14330 331 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GPR176Q14439 515 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM31Q5JXX7 168 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ARL9Q6T311 187 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PXKQ7Z7A4 578 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GRHL3Q8TE85 626 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM3CQ92520 227 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GABRG3Q99928 467 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MCUBQ9NWR8 336 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM25AB3EWG3 89 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM25CB3EWG5 89 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM25GB3EWG6 89 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 BRINP1O60477 761 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ARSBP15848 533 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ACTR1BP42025 376 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 EMDP50402 254 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR12D2P58182 307 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ACTR1AP61163 376 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SHC2P98077 582 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CRMP1Q14194 572 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MZT2AQ6P582 158 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FIGLAQ6QHK4 219 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 YAF2Q8IY57 180 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR10G6Q8NH81 332 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 C4orf36Q96KX1 117 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ENAMQ9NRM1 1142 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RASD1Q9Y272 281 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 DAPL1A0PJW8 107 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 H0YGG7 62 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PLPP2O43688 288 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R3DO95685 299 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RAB25P57735 213 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1CAP62136 330 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAPQ12884 760 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 NFATC4Q14934 902 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DS3Q14952 304 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAAH2Q6GMR7 532 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SYCE2Q6PIF2 218 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 COX18Q8N8Q8 333 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR51A7Q8NH64 312 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ZFAND1Q8TCF1 268 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PTCHD1Q96NR3 888 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 IFT27Q9BW83 186 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 IGFLR1Q9H665 355 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MCCC2Q9HCC0 563 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.34□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0B4J2E0 115 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GX12 115 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR6C74A6NCV1 312 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 EPOPA6NHQ4 379 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-16P01601 117 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SBK2P0C263 348 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SLC6A1P30531 599 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 HCCSP53701 268 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ADAM15Q13444 863 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FAM53BQ14153 422 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PLA1AQ53H76 456 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GPR135Q8IZ08 494 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ARL14Q8N4G2 192 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD1Q96SE0 405 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WV62 115 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC43A1O75387 559 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CBX7O95931 251 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GZMKP49863 264 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC3A1Q07837 685 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 AMZ1Q400G9 498 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TIGD3Q6B0B8 471 aa12.33□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms