RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 IRF8Q02556 426 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 FOLH1Q04609 750 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 K7EM74 188 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 SGK494L7N484 410 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 ETS1P14921 441 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 TAC1P20366 129 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 SSR2P43308 183 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 DIO3P55073 304 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 SELENOVP59797 346 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 PLGLB1Q02325 96 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 Q0VFX4 171 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 IFT88Q13099 833 aa3.83□□□□□ -1.8
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