RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492348.6

RBBP4-214, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 2

Gene RBBP4, Length 1,547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-214ENST00000492348 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 MRGPREQ86SM8 312 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 NRMQ8IXM6 262 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GPR135Q8IZ08 494 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 EID2Q8N6I1 236 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 BCORP1Q8N888 145 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PIGXQ8TBF5 258 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF721Q8TF20 911 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GGHQ92820 318 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PMM1Q92871 262 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 MPP4Q96JB8 637 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 NDC1Q9BTX1 674 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FGF21Q9NSA1 209 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SCN3BQ9NY72 215 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GPR83Q9NYM4 423 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 A0A0B4J2E0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 A0A1B0GX12 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 A8MUA0 341 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 H3BN98 237 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CDC42EP2O14613 210 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PRKYO43930 277 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ENTPD6O75354 484 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 IFNA16P05015 189 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 LCKP06239 509 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CDK1P06493 297 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TNNI3P19429 210 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GSTM3P21266 225 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 DRD5P21918 477 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FPR3P25089 353 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TGFBR2P37173 567 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SLC15A1P46059 708 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CDK5Q00535 292 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 NHLH1Q02575 133 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 COX10Q12887 443 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TSPAN31Q12999 210 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 AQP6Q13520 282 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TUBA3CQ13748 450 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 OR1Q1Q15612 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 P3H2Q8IVL5 708 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PFN4Q8NHR9 129 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 IFI44Q8TCB0 444 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 YIPF6Q96EC8 236 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 COPS4Q9BT78 406 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 NUDT9Q9BW91 350 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 Q9N2J8 555 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 AMBNQ9NP70 447 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 PRODH2Q9UF12 536 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP4-214ENST00000492348 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms