RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	MPI	P34949	423 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GZMK	P49863	264 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	NUDT6	P53370	316 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SIRPA	P78324	504 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	DPP10	Q8N608	796 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234		B2RBV5	119 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	HRK	O00198	91 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	AIM2	O14862	343 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	TCF21	O43680	179 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SLITRK5	O94991	958 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ANP32D	O95626	131 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	THBD	P07204	575 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SOD3	P08294	240 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CDKN1A	P38936	164 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	STAR	P49675	285 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	NUDT2	P50583	147 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CTBP2	P56545	445 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	NFYC	Q13952	458 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MLC1	Q15049	377 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	REP15	Q6BDI9	236 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PROX1	Q92786	737 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	RCN3	Q96D15	328 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SH3GL1	Q99961	368 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234		A0A096LPI6	279 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1W2PRB8	838 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	RFXANK	O14593	260 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GYG2	O15488	501 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	SSX4	O60224	188 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PLAU	P00749	431 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	T-ENOL	P0DO92	83 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	LAMP1	P11279	417 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	BMP4	P12644	408 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	IL11	P20809	199 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	CFP	P27918	469 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	C18orf63	Q68DL7	685 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM64	Q6YI46	380 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SBF1-208	ENST00000477234	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65

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