RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RAMP1	O60894	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	B3GAT3	O94766	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	JCHAIN	P01591	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CAPN1	P07384	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TPSB2	P20231	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HPCAL1	P37235	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC1A4	P43007	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SLIT1	O75093	1534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A087WWV3	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378		E9PBE3	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR7A17	O14581	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHL41	O60662	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	FCMR	O60667	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ECI2	O75521	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	AMBP	P02760	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ACADS	P16219	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SDC1	P18827	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TDO2	P48775	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SPAG1	Q07617	926 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PNOC	Q13519	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZIC1	Q15915	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	WBP1	Q96G27	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ART5	Q96L15	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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