RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 FAHD1Q6P587 224 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 TEX261Q6UWH6 196 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 HSDL2Q6YN16 418 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 GALNT10Q86SR1 603 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ASPGQ86U10 573 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 TEX37Q96LM6 180 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 MMP28Q9H239 520 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 OR51E2Q9H255 320 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 IL26Q9NPH9 171 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 CUTCQ9NTM9 273 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ING4Q9UNL4 249 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 CMAHPQ9Y471 501 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF175Q9Y473 711 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 HSPB11Q9Y547 144 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 E5RI56 91 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 CLDN4O14493 209 aa5.94□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 SCO1O75880 301 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 OR4F21O95013 312 aa5.94□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 CD1DP15813 335 aa5.94□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 AKT1P31749 480 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ADRA1AP35348 466 aa5.94□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 PGGT1BP53609 377 aa5.94□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 KIAA0040Q15053 153 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF79Q15937 498 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL12Q53G59 568 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SPINK14Q6IE38 97 aa5.94□□□□□ -1.46
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