RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 AMER2Q8N7J2 671 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51A7Q8NH64 312 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM163Q8TC26 289 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SAP25Q8TEE9 199 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NACC2Q96BF6 587 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1F2PQ96R84 312 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IER2Q9BTL4 223 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX12Q9BXU0 123 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51E2Q9H255 320 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52D1Q9H346 318 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GAREM1Q9H706 876 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HHATLQ9HCP6 504 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MED31Q9Y3C7 131 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 EML5Q05BV3 1969 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GX78 115 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PQM1 296 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SERINC4A6NH21 518 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC119BA6NIH7 251 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM183AA6NL82 134 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DSCR3O14972 297 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF4O43474 513 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FMO6PO60774 539 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RFPL3O75679 317 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LYPD3O95274 346 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CLPSP04118 112 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXA6P31267 233 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GRK5P34947 590 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RORAP35398 523 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS6P49758 472 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CCR4P51679 360 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 EFNA3P52797 238 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC37A1P57057 533 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DAB2P98082 770 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 EFNB1P98172 346 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DOC2BQ14184 412 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FGFBP1Q14512 234 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NR0B2Q15466 257 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF141Q15928 474 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PGGHGQ32M88 737 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF613Q6PF04 617 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SHFQ7M4L6 423 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF550Q7Z398 422 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T33Q8NG76 320 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4C6Q8NH72 309 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM2Q9C040 744 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 UBQLN3Q9H347 655 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DMDP11532 3685 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FRYLO94915 3013 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0B4J2E0 115 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GX12 115 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SNTNA6NMZ2 147 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL12BO14950 172 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SURF4O15260 269 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRODHO43272 600 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms