RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391173.1

RNU6-400P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 400, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-400P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-400P-201ENST00000391173 PVRP15151 417 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PTNP21246 168 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GRK5P34947 590 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ADCYAP1R1P41586 468 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 EPS15P42566 896 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SLC1A6P48664 564 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CSNK1A1P48729 337 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PITPNBP48739 271 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 RGS7P49802 495 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 RAD23BP54727 409 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MFAP2P55001 183 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 EVCP57679 992 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 HERVK_113P63132 956 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ERVK-8P63133 956 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ERVK-25P63136 954 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CDK18Q07002 472 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TFCP2Q12800 502 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 IKQ13123 557 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 BIKQ13323 160 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MAB21L1Q13394 359 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MAMLD1Q13495 774 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GPR50Q13585 617 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GCKRQ14397 625 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 NDUFA9Q16795 377 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 INSCQ1MX18 579 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GAGE2EQ4V326 116 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 RAB41Q5JT25 222 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ERMARDQ5T6L9 678 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 GDF5OSQ5U4N7 250 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 OR2A2Q6IF42 318 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MOB3CQ70IA8 216 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 LINGO2Q7L985 606 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 NUDT13Q86X67 352 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CDK20Q8IZL9 346 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TAGAPQ8N103 731 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MIER2Q8N344 545 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 WDTC1Q8N5D0 677 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PAF1Q8N7H5 531 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 LINC00469Q8N7U9 141 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TCEANCQ8N8B7 351 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SAMD12Q8N8I0 201 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SLC43A3Q8NBI5 491 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CLRN3Q8NCR9 226 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SMC1BQ8NDV3 1235 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 BEST2Q8NFU1 509 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 IPMKQ8NFU5 416 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 OR4K5Q8NGD3 323 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 OR4D10Q8NGI6 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 OR9I1Q8NGQ6 314 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 HUS1BQ8NHY5 278 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 DTX3LQ8TDB6 740 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 COG1Q8WTW3 980 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 NAT14Q8WUY8 206 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 IRGQQ8WZA9 623 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 KCNJ9Q92806 393 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TOP1MTQ969P6 601 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PBXIP1Q96AQ6 731 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 FBXL8Q96CD0 374 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 AP2M1Q96CW1 435 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ELP4Q96EB1 424 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 SEH1LQ96EE3 360 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MASTLQ96GX5 879 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CNDP1Q96KN2 507 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 LRRC3BQ96PB8 259 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TBX5Q99593 518 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MECRQ9BV79 373 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 HCAR1Q9BXC0 346 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ERVK-6Q9BXR3 956 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CNFNQ9BYD5 112 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 DPH1Q9BZG8 443 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TGIF2Q9GZN2 237 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 LMAN2LQ9H0V9 348 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TRPV6Q9H1D0 765 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 NEUROG2Q9H2A3 272 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 OR51V1Q9H2C8 321 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 MUC13Q9H3R2 512 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 BPIFA1Q9NP55 256 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 VTA1Q9NP79 307 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 TRPV5Q9NQA5 729 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 CCL28Q9NRJ3 127 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-400P-201ENST00000391173 RDH8Q9NYR8 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms