RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 UNC13CQ8NB66 2214 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CD8B2A6NJW9 211 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GALT2O43825 422 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPD3O95274 346 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT1P04628 370 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM157BP0CG42 384 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CD8BP10966 210 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SRFP11831 508 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP2K3P46734 347 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BDH1Q02338 343 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RIN1Q13671 783 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 P2RY14Q15391 338 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 Q5BKY6 102 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PLBD1Q6P4A8 553 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GLCTQ6Y288 498 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BHLHE40O14503 412 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MAKP20794 623 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NIPAL3Q6P499 406 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PLET1Q6UQ28 207 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LIX1LQ8IVB5 337 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf18Q8NEA5 215 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FN3KQ9H479 309 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNE5Q9UJ90 142 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 COL4A2P08572 1712 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DBIP07108 87 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FUT1P19526 365 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TBXA2RP21731 343 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ALAS2P22557 587 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TCTE3Q8IZS6 198 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ACBD7Q8N6N7 88 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 OTULINQ96BN8 352 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PILRAQ9UKJ1 303 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 STX11O75558 287 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GKN3PP0CG01 181 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CD83Q01151 205 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HHEXQ03014 270 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1Q1Q15612 314 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SIX5Q8N196 739 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PFN4Q8NHR9 129 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FANK1Q8TC84 345 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFPM2Q8WW38 1151 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB12Q8WXK4 309 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HS6ST2Q96MM7 605 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CD180Q99467 661 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC61Q9BV99 259 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL21Q9UJP4 597 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MAU2Q9Y6X3 613 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 URADA6NGE7 173 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf71A8MTZ7 269 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YGG7 62 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NID1P14543 1247 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RABIFP47224 123 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DCST2Q5T1A1 773 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIQKQ629K1 86 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM239Q8WW34 195 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNJ15Q99712 375 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BEX2Q9BXY8 128 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MED20Q9H944 212 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MALT1Q9UDY8 824 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL21Q9UKT6 434 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SATB2Q9UPW6 733 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH15Q96QU1 1955 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DVL2O14641 736 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF13O43567 381 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TATDN3Q17R31 274 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MZT2BQ6NZ67 158 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MZT2AQ6P582 158 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LNX2Q8N448 690 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms