RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF550Q7Z398 422 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 COQ7Q99807 217 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM54-201ENST00000296098 MAOBP27338 520 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 OR51A7Q8NH64 312 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 TMED9Q9BVK6 235 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 CHRDQ9H2X0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 KLHL12Q53G59 568 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 OR10A5Q9H207 317 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC43A2Q8N370 569 aa22.07■■□□□ 1.12
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TRIM54-201ENST00000296098 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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