RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 SMPDL3AQ92484 453 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 KCND3Q9UK17 655 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 E9PI62 339 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 PLPP1O14494 284 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SHOXO15266 292 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HPXP02790 462 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 PRKACAP17612 351 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SOX2P48431 317 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CEBPGP53567 150 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 PNLIPRP1P54315 467 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 KIAA1024LP59773 190 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 RAB40BQ12829 278 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SP140Q13342 867 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 GRK1Q15835 563 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 AANATQ16613 207 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 C4orf46Q504U0 113 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 LIPIQ6XZB0 460 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 VRK2Q86Y07 508 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 NRMQ8IXM6 262 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR8K5Q8NH50 307 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 RGMAQ96B86 450 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR10A4Q9H209 315 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 MED31Q9Y3C7 131 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SEC16AO15027 2179 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 RTTNQ86VV8 2226 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 M0R233 179 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ALDOBP05062 364 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 S100A6P06703 90 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 M6PRP20645 277 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HSD3B2P26439 372 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 NUDT1P36639 197 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 PITPNBP48739 271 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HCCSP53701 268 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ADAM8P78325 824 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 BTN3A2P78410 334 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HSD17B8Q92506 261 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 DDOQ99489 341 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CALML5Q9NZT1 146 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1B0GVT2 93 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FZD7O75084 574 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf105O95561 183 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 IFNA7P01567 189 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HMGN1P05114 100 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 FOSL2P15408 326 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 HK1P19367 917 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 METAP1P53582 386 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ST3GAL2Q16842 350 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 OR56A3Q8NH54 315 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ST8SIA2Q92186 375 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 SAMD8Q96LT4 415 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 KCNJ15Q99712 375 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF576Q9H609 170 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 CD207Q9UJ71 328 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD9-216ENST00000620854 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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