RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	GCK	P35557	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NR4A2	P43354	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	F2RL1	P55085	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TPTE	P56180	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HSD17B7	P56937	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FUT7	Q11130	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PKP1	Q13835	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RUNX2	Q13950	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB35	Q15286	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		Q6ZWC4	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ASPG	Q86U10	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MMP27	Q9H306	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CLOCK	O15516	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANXA9	O76027	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NCR1	O76036	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TPPP	O94811	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ACSL3	O95573	720 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TGM6	O95932	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF23	P17027	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KDELR1	P24390	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	POU1F1	P28069	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CDA	P32320	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NR2C2	P49116	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KLK7	P49862	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF84	P51523	738 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	EFNA4	P52798	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GEM	P55040	296 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		Q6ZPA2	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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