RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF836Q6ZNA1 936 aa30.01■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHDC3Q9BQ90 382 aa30.01■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5M1Q8NGP8 315 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO27Q8NI29 283 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNPLA3Q9NST1 481 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM181Q9P2C4 612 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL7A1L3X0 281 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QX08 132 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFN2O95140 757 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADH6P28332 368 aa29.95■■■□□ 2.38
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