RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC154A6NI56 674 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 A6NNC1 897 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF264O43296 627 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC22A3O75751 556 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 UGT2B17O75795 530 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FUT5Q11128 374 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPAT3Q53EU6 434 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 HBMQ6B0K9 141 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 LILRA2Q8N149 483 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR119Q8TDV5 335 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ROPN1LQ96C74 230 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRG7Q96K78 797 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR45Q9Y484 360 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF195O14628 629 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLF11O14901 512 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYNGR4O95473 234 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSTAP01040 98 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRHP06850 196 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 IDO1P14902 403 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SORDQ00796 357 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM27E3Q08E93 113 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 QPRTQ15274 297 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 POU4F3Q15319 338 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF141Q15928 474 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAPK14Q16539 360 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5W2Q8NH69 310 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLHL15Q96M94 604 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASSF1Q9NS23 344 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 MSTNO14793 375 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBDO15205 165 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 EFNA2O43921 213 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA0513O60268 411 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 AGR2O95994 175 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPXP11678 715 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FCGR2AP12318 317 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRKCAP17252 672 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNJ5P48544 419 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 HPCAP84074 193 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CBFBQ13951 182 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKFN1Q8N957 763 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 OSTF1Q92882 214 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZG16BQ96DA0 208 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 LIME1Q9H400 295 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PROCRQ9UNN8 238 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMGN4O00479 90 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 RFXANKO14593 260 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMDEC1O15204 470 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 H6PDO95479 791 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARD18P57730 90 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHRNEQ04844 493 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SKP2Q13309 424 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYPL1Q16563 259 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSTA3Q16772 222 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 COX20Q5RI15 118 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAT2Q9GZY6 243 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms