RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	DEPP	Q9NTK1	212 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730		G3V3Y1	287 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SUSD5	O60279	629 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CYP7B1	O75881	506 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	C1QC	P02747	245 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	HPN	P05981	417 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF17	P17021	662 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	DPP4	P27487	766 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	HTR3A	P46098	478 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	MAPK11	Q15759	364 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	FXN	Q16595	210 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ASB9	Q96DX5	294 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	DSN1	Q9H410	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	EXO5	Q9H790	373 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf72	A4D263	438 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	OR14I1	A6ND48	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CCR4	P51679	360 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SELENOW	P63302	87 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	MAPK14	Q16539	360 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730		Q8NA96	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF559	Q9BR84	538 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	GJE1	A6NN92	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	AP3D1	O14617	1153 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	FMO6P	O60774	539 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CIB2	O75838	187 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	LGI1	O95970	557 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ACTL6A	O96019	429 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	EDN3	P14138	238 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	HK1	P19367	917 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CHM	P24386	653 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	KCNJ5	P48544	419 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF117	Q03924	483 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	SKP2	Q13309	424 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CD226	Q15762	336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-224	ENST00000534730	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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