RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517179.1

RNU6-111P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 111, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-111P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-111P-201ENST00000517179 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 KARSQ15046 597 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SPATA1Q5VX52 437 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 FRMPD2BQ6IN97 320 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 HACD2Q6Y1H2 254 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 STAC2Q6ZMT1 411 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCDC186Q7Z3E2 898 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 MFSD6LQ8IWD5 586 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMEM104Q8NE00 496 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ACER1Q8TDN7 264 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 VPS33AQ96AX1 596 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 INTS14Q96SY0 518 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TM2D3Q9BRN9 247 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ACPTQ9BZG2 426 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 FAM114A2Q9NRY5 505 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF226Q9NYT6 803 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 C5AR2Q9P296 337 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCL27Q9Y4X3 112 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 A0A0G2JN53 185 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PPIHO43447 177 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 GLCEO94923 617 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 JCHAINP01591 159 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 P04436 131 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PRKCIP41743 596 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 EMDP50402 254 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 GZMMP51124 257 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SGSHP51688 502 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 HERV-K104P63124 156 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CYBRD1Q53TN4 286 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLX4IPQ5VYV7 408 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PNCKQ6P2M8 343 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SPATA19Q7Z5L4 167 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC22A16Q86VW1 577 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMEM126BQ8IUX1 230 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 NRMQ8IXM6 262 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SMC5Q8IY18 1101 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CENPSQ8N2Z9 138 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 UXS1Q8NBZ7 420 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 DTX3LQ8TDB6 740 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 NAPBQ9H115 298 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PFDN4Q9NQP4 134 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ACOXLQ9NUZ1 547 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF337Q9Y3M9 751 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PTPRUQ92729 1446 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CHEK1O14757 476 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF263O14978 683 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TM9SF1O15321 606 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SUPT3HO75486 399 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 GFPT2O94808 682 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SERPINF2P08697 491 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 C8orf89P0DMQ9 161 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 IFI30P13284 250 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TDGF1P13385 188 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 IL11P20809 199 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 FCARP24071 287 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ASMTP46597 345 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TDGF1P3P51864 188 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PITPNAQ00169 270 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 PRKCDQ05655 676 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 EPC2Q52LR7 807 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 FAM120AOSQ5T036 256 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ATF7IP2Q5U623 682 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TEX19Q8NA77 164 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 CNNM3Q8NE01 707 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 C1orf64Q8NEQ6 169 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC5A11Q8WWX8 675 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 HIST1H2ACQ93077 130 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 DOK1Q99704 481 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 NLNQ9BYT8 704 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMEM161AQ9NX61 479 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 TREM2Q9NZC2 230 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-111P-201ENST00000517179 A0A1B0GUL7 405 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 IDSB3KWA1 339 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 UBE2CO00762 179 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 CD5LO43866 347 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 GMNNO75496 209 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC16A8O95907 504 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 ADRB2P07550 413 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-111P-201ENST00000517179 SFTPBP07988 381 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms