RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497638.2

VPS45-210, Transcript of vacuolar protein sorting 45 homolog, humanhuman

TSL 2

Gene VPS45, Length 1,135 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45-210ENST00000497638 TAPBPO15533 448 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TMPRSS11DO60235 418 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 REM1O75628 298 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 NCR1O76036 304 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TUBBP07437 444 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 CPMP14384 443 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 CREB1P16220 341 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 S1PR1P21453 382 aa6.69□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 DRD5P21918 477 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TTKP33981 857 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PIK3CBP42338 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PPICP45877 212 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SLC6A8P48029 635 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 HSPA7P48741 367 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 EFNA4P52798 201 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 C21orf58P58505 322 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 SLMAPQ14BN4 828 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.69□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 FADS6Q8N9I5 356 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 BANPQ8N9N5 519 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TMBIM1Q969X1 311 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 CERS2Q96G23 380 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 RADILQ96JH8 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 NAT9Q9BTE0 207 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PRODH2Q9UF12 536 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 TMEM89A2RUT3 159 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 VWC2LB2RUY7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 B4DXG7 233 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 RAMP1O60894 148 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 EPORP19235 508 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 IL12BP29460 328 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 AGTR1P30556 359 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 BSGP35613 385 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 KRT20P35900 424 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 GAS1P54826 345 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PHEXP78562 749 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 P2RY6Q15077 328 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 Q6YL49 198 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 NUDT13Q86X67 352 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 BTBD9Q96Q07 612 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS45-210ENST00000497638 DSN1Q9H410 356 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 ZNF639Q9UID6 485 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS45-210ENST00000497638 PLLPQ9Y342 182 aa6.68□□□□□ -1.34
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