RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC1A6	P48664	564 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RX1	P51575	399 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP12A	P54707	1039 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF527	Q8NB42	609 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGT	Q969N2	578 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SDF2	Q99470	211 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PROCR	Q9UNN8	238 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		H7C1Q1	480 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF11	O14788	317 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD28	O15084	1053 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	EFNA2	O43921	213 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCL13	O43927	109 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SMPD2	O60906	423 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYGS	P22914	178 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PCSK6	P29122	969 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXF1	Q12946	379 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PGS1	Q32NB8	556 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MARK4	Q96L34	752 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL15	Q96M94	604 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BDH2	Q9BUT1	245 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GLRX2	Q9NS18	164 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		15.86	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DUXA	A6NLW8	204 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf97	H3BN30	126 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BNH8	94 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NTN1	O95631	604 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OPN1LW	P04000	364 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BGN	P21810	368 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MATN1	P21941	496 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ME2	P23368	584 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SHC1	P29353	583 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SOAT1	P35610	550 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PHC1	P78364	1004 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HBM	Q6B0K9	141 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	LILRA2	Q8N149	483 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR119	Q8TDV5	335 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TESC	Q96BS2	214 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF524	Q96C55	264 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ROS1	P08922	2347 aa		15.85	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DSCAM	O60469	2012 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ESPN	B1AK53	854 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	AK1	P00568	194 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKCA	P17252	672 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF141	Q15928	474 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO27	Q8NI29	283 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OSTF1	Q92882	214 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		Q96MF0	132 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MED18	Q9BUE0	208 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DPY30	Q9C005	99 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		15.84	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		15.84	■□□□□ 0.13

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