RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR89BP0CG08 455 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MAKP20794 623 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MTNR1BP49286 362 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF136P52737 540 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10A3P58181 314 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RPE65Q16518 533 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRLBQ6BAA4 426 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC73Q6P1J9 531 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR88Q6ZMY6 472 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GID4Q8IVV7 300 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAPC3Q92966 411 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf90Q96M02 699 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS27Q9BQR3 290 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ENAMQ9NRM1 1142 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PI62 339 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 BTN3A3O00478 584 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TFPIP10646 304 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NTSR1P30989 418 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HBMQ6B0K9 141 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCZ1Q86YW0 608 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7G1Q8NGA0 311 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52L1Q8NGH7 329 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5M3Q8NGP4 307 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5W2Q8NH69 310 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51V1Q9H2C8 321 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPAL2Q9H841 368 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA7E9PJI5 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2B3O76000 313 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA8P0DM63 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI30P13284 250 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TALDO1P37837 337 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ID2Q02363 134 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TNK1Q13470 666 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK14Q16539 360 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZS52 159 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 VN1R4Q7Z5H5 301 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RASD1Q9Y272 281 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPB11Q9Y547 144 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP54Q96N23 3096 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 POM121BA6NF01 834 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TEAD1P28347 426 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSL1P33121 698 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ARFIP1P53367 373 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC3A1Q07837 685 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MAB21L1Q13394 359 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF425Q6IV72 752 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CD180Q99467 661 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 JAM3Q9BX67 310 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM36Q9NQ86 728 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CYSLTR2Q9NS75 346 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB6O75190 326 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP7P18075 431 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR2AP28223 471 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf50Q8WW18 174 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RFT1Q96AA3 541 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SDF2Q99470 211 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCG5Q9H222 651 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CD207Q9UJ71 328 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BHLHE40O14503 412 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP12AP54707 1039 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ADPRHP54922 357 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 E2F1Q01094 437 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BDH1Q02338 343 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SGCGQ13326 291 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CREB3L1Q96BA8 519 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HS6ST2Q96MM7 605 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CITED4Q96RK1 184 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SARGQ9BW04 601 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL1Q9NR64 748 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C5AR1P21730 350 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GALP22466 123 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms