RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373115.4

CHST3-201, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST3, Length 6,970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3-201ENST00000373115 TSSK4Q6SA08 328 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SBSNQ6UWP8 590 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF546Q86UE3 836 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.68□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 KLHL33A6NCF5 533 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 GCH1P30793 250 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 CXADRP78310 365 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MPP7Q5T2T1 576 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 V9GY05 133 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR7A17O14581 309 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 FADS1O60427 444 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 AHRP35869 848 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 CHST14Q8NCH0 376 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 GABRA2P47869 451 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MELKQ14680 651 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 NIPAL3Q6P499 406 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MOB3CQ70IA8 216 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 EHFQ9NZC4 300 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 CBR1P16152 277 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ELP4Q96EB1 424 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MICU1Q9BPX6 476 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR10A5Q9H207 317 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR10A2Q9H208 303 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MEGF11A6BM72 1044 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SURF4O15260 269 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 DOK2O60496 412 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 UBL4AP11441 157 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 INTS14Q96SY0 518 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PRRT1Q99946 306 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 CHRM4P08173 479 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 GK3PQ14409 553 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 C18orf63Q68DL7 685 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 LIPIQ6XZB0 460 aa14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 EPHA4P54764 986 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 COX15Q7KZN9 410 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 A0A0B4J2A0 478 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 WASH4PA8MWX3 477 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 TIMP2P16035 220 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 TLE1Q04724 770 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 LTBQ06643 244 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 BCL7AQ4VC05 210 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 PIGCQ92535 297 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SERINC5Q86VE9 423 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 EFCAB7A8K855 629 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 BHLHE40O14503 412 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ZNF28P17035 718 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 TNK1Q13470 666 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 SPCS2Q15005 226 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 Q9Y3F1 56 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 E9PI62 339 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OMGP23515 440 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 AAK1Q2M2I8 961 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.66□□□□□ -0.06
CHST3-201ENST00000373115 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.9 ms