RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KIR2DL3P43628 341 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SLC7A13Q8TCU3 470 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 POLE3Q9NRF9 147 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PRSS38A1L453 326 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 IL32P24001 234 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GNALP38405 381 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SMCO1Q147U7 214 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 H0Y8X5 98 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM2Q9C040 744 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FBRSQ9HAH7 460 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 HHATLQ9HCP6 504 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0G2JMP0 313 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FZD7O75084 574 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TCRBP04435 133 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SHC1P29353 583 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ETV5P41161 510 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ETV1P50549 477 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SYT14P1Q58G82 188 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 THEM6Q8WUY1 208 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SGTBQ96EQ0 304 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DGAT2Q96PD7 388 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf226A1L170 272 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PRAF2O60831 178 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SCO1O75880 301 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OLFM2O95897 454 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GPR50Q13585 617 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TP53I3Q53FA7 332 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR56B4Q8NH76 319 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 IFT46Q9NQC8 304 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PSME4Q14997 1843 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR5K4A6NMS3 321 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 AHCYP23526 432 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RABIFP47224 123 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GBX1Q14549 363 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 HBMQ6B0K9 141 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MAP6Q96JE9 813 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RCE1Q9Y256 329 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PPL8 197 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 UCHL1P09936 223 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PGGHGQ32M88 737 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM215Q68D42 235 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR4K13Q8NH42 304 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PINK1Q9BXM7 581 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 STARD5Q9NSY2 213 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MED16Q9Y2X0 877 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RGS13O14921 159 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GRPRP30550 384 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 BEST3Q8N1M1 668 aa15.97■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms