RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 MPPED2Q15777 294 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF77Q15935 545 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GSG1Q2KHT4 349 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A19Q695T7 634 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRA6Q6PI73 481 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SZRD1Q7Z422 152 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPAT4Q86UL3 456 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 COMMD7Q86VX2 200 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM25Q86YD3 366 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CPOQ8IVL8 374 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL6Q8N531 539 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C6Q8NH72 309 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD4Q8TB40 342 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 YIPF5Q969M3 257 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM19Q96E16 107 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ELP4Q96EB1 424 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TOX2Q96NM4 488 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 STACQ99469 402 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF559Q9BR84 538 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MED11Q9P086 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RASD1Q9Y272 281 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MED31Q9Y3C7 131 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IRAK3Q9Y616 596 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA6W5XKT8 324 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CD8B2A6NJW9 211 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ACOT7O00154 380 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BHLHE40O14503 412 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 B4GALT2O60909 372 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PPM1BO75688 479 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GALNT1O75752 331 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 AQP8O94778 261 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP1B1P05026 303 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SBK2P0C263 348 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CD8BP10966 210 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 UBL4AP11441 157 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMP2P13473 410 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C6P13671 934 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ADRB3P13945 408 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IL32P24001 234 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BTCP35070 178 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF81P51508 661 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DLX5P56178 289 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVK-21P61565 698 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 DOC2BQ14184 412 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPNMBQ14956 572 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF4Q15306 451 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM20Q15388 145 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 AANATQ16613 207 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC36A2Q495M3 483 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LHX8Q68G74 356 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 VASNQ6EMK4 673 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms