RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		A8MUA0	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIN1P1	O15428	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	EMC8	O43402	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CHST10	O43529	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HCRTR2	O43614	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TJP3	O95049	919 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADA	P00813	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HKR1	P10072	659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TYK2	P29597	1187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXN2	P32314	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HSD17B2	P37059	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	BDKRB1	P46663	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAMP	P49913	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NAGLU	P54802	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLURP1	P55000	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	UBXN1	Q04323	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMED2	Q15363	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PHKG1	Q16816	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MORN4	Q8NDC4	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR78	Q96P69	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VAT1	Q99536	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		H7C417	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GFY	I3L273	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CDC7	O00311	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCL22	O00626	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRY	O14603	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT34	O76011	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX4	O95219	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AGT	P01019	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FER	P16591	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADRA1A	P35348	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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