RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531616.1

ARHGEF12-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF12, Length 3,108 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-211ENST00000531616 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 A0A0U1RQF3 1178 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ILVBLA1L0T0 632 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMEM114B3SHH9 223 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 HSPA12AO43301 675 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 HUS1O60921 280 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 FCN3O75636 299 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SERPIND1P05546 499 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RNF224P0DH78 156 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LHCGRP22888 699 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 GHRHRQ02643 423 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NUDT9Q9BW91 350 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RETNQ9HD89 108 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 GID8Q9NWU2 228 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RAXQ9Y2V3 346 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RNF222A6NCQ9 220 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMEM202A6NGA9 273 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NDUFB10O96000 172 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 PGK1P00558 417 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 KDELR2P33947 212 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 GPR12P47775 334 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ART1P52961 327 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TPTEP56180 551 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 CDSNQ15517 529 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 C5orf47Q569G3 176 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 M1APQ8TC57 530 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ASB5Q8WWX0 329 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RAB39BQ96DA2 213 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TCF19Q9Y242 345 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 PP2D1A8MPX8 630 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SGK494L7N484 410 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC37A4O43826 429 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC19A2O60779 497 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 HPXP02790 462 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR4E1P0C645 316 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NFYCQ13952 458 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 CD163Q86VB7 1156 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TRIM69Q86WT6 500 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 THAP8Q8NA92 274 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF503Q96F45 646 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 PARVAQ9NVD7 372 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LRRN3E7EW58 273 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LEFTY2O00292 366 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 HSD11B1P28845 292 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 CD1CP29017 333 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ADGRE1Q14246 886 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SHBQ15464 509 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 WDR59Q6PJI9 974 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 NANPQ8TBE9 248 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 GIPC3Q8TF64 312 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 SMPDL3AQ92484 453 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 RND1Q92730 232 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 C9orf72Q96LT7 481 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 C3orf30Q96M34 536 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 TGM7Q96PF1 710 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 BATF3Q9NR55 127 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 UBE2QL1A1L167 161 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 MYMKA6NI61 221 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 A8MUA0 341 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF12-211ENST00000531616 H3BN98 237 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms