RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF766Q5HY98 468 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SPTA1P02549 2419 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 GPIP06744 558 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM87AP0C7U9 286 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TPD52L3Q96J77 140 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGDIGQ99819 225 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 DEPPQ9NTK1 212 aa20.08■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.08■□□□□ 0.81
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PACSIN3-205ENST00000528462 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF117Q03924 483 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXO1Q12778 655 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 CBLN3Q6UW01 205 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA24Q86W54 205 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 FADS6Q8N9I5 356 aa20.08■□□□□ 0.8
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PACSIN3-205ENST00000528462 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 HES7Q9BYE0 225 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 HCRTR2O43614 444 aa20.07■□□□□ 0.8
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PACSIN3-205ENST00000528462 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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PACSIN3-205ENST00000528462 IFI44LQ53G44 452 aa20.07■□□□□ 0.8
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PACSIN3-205ENST00000528462 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SULF2Q8IWU5 870 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ARSGQ96EG1 525 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL1Q9NR64 748 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A0G2JMM0 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PPB8 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PRS3 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 DHRS12A0PJE2 317 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 B4DXG7 233 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 FAAHO00519 579 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 PEX1O43933 1283 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 DNASE1L1P49184 302 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RX1P51575 399 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ST3GAL2Q16842 350 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.06■□□□□ 0.8
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PACSIN3-205ENST00000528462 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 OR5W2Q8NH69 310 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 C7orf34Q96L11 122 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF597Q96LX8 424 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf72A6NCS6 295 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 OIP5O43482 229 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 FMO6PO60774 539 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SFTPCP11686 197 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC6A8P48029 635 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 MASP1P48740 699 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF136P52737 540 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-205ENST00000528462 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.05■□□□□ 0.8
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