RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518290.1

ARFGEF1-204, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARFGEF1, Length 3,179 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-204ENST00000518290 CAPZA2P47755 286 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 RGS6P49758 472 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 AHSA2Q719I0 299 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 CAPN10Q9HC96 672 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 EQTNQ9NQ60 294 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 RASSF1Q9NS23 344 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.4□□□□□ -1.22
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A1B0GX78 115 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 RAB36O95755 333 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CD1AP06126 327 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 HTR1FP30939 366 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 PTGER1P34995 402 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC9A3P48764 834 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 BCAP31P51572 246 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 MLLT10P55197 1068 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 KLHL22Q53GT1 634 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 C16orf87Q6PH81 154 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZAR1Q86SH2 424 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 BCORP1Q8N888 145 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 PIK3R3Q92569 461 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ART5Q96L15 291 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 MED18Q9BUE0 208 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 STARD5Q9NSY2 213 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CBLCQ9ULV8 474 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 EYSQ5T1H1 3165 aa7.4□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 PEX12O00623 359 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TSPAN2O60636 221 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 HMGN1P05114 100 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 LCKP06239 509 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CD53P19397 219 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 GABRA3P34903 492 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SSX1Q16384 188 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TIGD6Q17RP2 521 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CASP12Q6UXS9 341 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 USP43Q70EL4 1123 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 MFSD4AQ8N468 514 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM239Q8WW34 195 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC9A6Q92581 669 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 BORCS5Q969J3 196 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TP53INP1Q96A56 240 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 DDOQ99489 341 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 Q9N2J8 555 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 AASSQ9UDR5 926 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SNTNA6NMZ2 147 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 PTGES3LE9PB15 166 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 M0R3G1 203 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CDC42EP2O14613 210 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CSO75390 466 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF883P0CG24 379 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SKP2Q13309 424 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 GPR50Q13585 617 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TPBGQ13641 420 aa7.39□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 GINS1Q14691 196 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms